—— Panliten Kolaboratif dening Zhejiang CDC, Macro & Micro-Test, lan China CDC Dipublikasikake ing Frontiers in Cellular and Infection Microbiology
Ringkesan Sinau
Ing Mei 2026, Frontiers in Cellular and Infection Microbiology (JCR Q1, IF ≈ 4.6) nerbitake makalah sing dipimpin dening Pusat Pengendalian lan Pencegahan Penyakit Provinsi Zhejiang (Zhejiang CDC), karo tim bioinformatika saka Beijing Macro & Micro-Test Bio-Tech Co., Ltd. lan Institut Nasional Pengendalian lan Pencegahan Penyakit Menular (China CDC) minangka penulis bareng. Panliten iki nduweni irah-irahan:
"Identifikasi lan analisis filogenetik saka pitung galur Brucella abortus ing Zhejiang, China."
Panliten iki minangka analisis ketertelusuran filogenetik sistematis lan berbasis genom lengkap sing pertama saka Brucella abortus (B. abortus) ing Provinsi Zhejiang, China. Tim kasebut nganalisa pitung isolat sing diklumpukake saka taun 2015 nganti 2025 (papat galur asal manungsa lan telung galur asal sapi saka Jinhua, Quzhou, lan Ningbo). Temuan kasebut nyedhiyakake bukti genomik kanggo asal-usul lan rute transmisi "spesies dominan lor" iki ing wilayah epidemi kidul sing atipikal ing China wétan.
Latar Belakang lan Pentinge
Brucellosis iku penyakit zoonotik sing disebabake dening bakteri saka genus Brucella. Brucella abortus utamane nginfeksi sapi nanging uga bisa nyebabake penyakit ing manungsa. Ing China, brucellosis nuduhake variasi geografis sing jelas: insidensi paling dhuwur kedadeyan ing provinsi lor (kayata, Mongolia Dalam, Shanxi, Heilongjiang). Kosok baline, provinsi kidul, kalebu Zhejiang, sacara historis didominasi dening Brucella melitensis, kanthi kasus B. abortus sing dilapurake sithik banget. Disparitas regional iki ndadekake karakterisasi genetik lan pelacakan sumber B. abortus ing Zhejiang dadi prioritas kesehatan masyarakat sing penting.
Metode lan Temuan Penting
Tim riset iki ngadopsi strategi multi-cabang sing nggabungake biologi molekuler lan bioinformatika:
1.Identifikasi patogen lan tipe dhasar
PCR gen BCSP-31 lan AMOS-PCR ngonfirmasi manawa kabeh pitu isolat kasebut minangka B. abortus.
Tipe urutan multilokus (MLST) adhedhasar sangang gen housekeeping nuduhake yen kabeh isolat kalebu jinis urutan ST2, sing nuduhake homogenitas genetik sing dhuwur ing antarane galur B. abortus sing sirkulasi ing Zhejiang.
2.Karakterisasi genom sakabèhé
Sekuensing sak kabèh genom ditindakake ing platform Illumina NovaSeq. Analisis identitas nukleotida rata-rata (ANI) nuduhaké yèn isolat Zhejiang nduwèni kamiripan nganti 99,99% karo galur referensi B. abortus 544.
Analisis pan-genome nuduhake populasi sing lestari banget: 3.084 gen inti diidentifikasi, bebarengan karo mung 10 gen cangkang, lan ora ana gen inti alus utawa awan sing dideteksi.
3.Profil gen virulensi lan resistensi antimikroba
Ana total 68 faktor sing ana gandhengane karo virulensi sing diprediksi, sing nyakup jalur klasik kayata biosintesis LPS, sistem sekresi T4SS, lan sistem pengaturan rong komponen BvrR-BvrS. Khususé, kabeh isolat ora nduweni gen adhesin bmaA lan btaF. Analisis gen resistensi mung ndeteksi gen mprF ing basis data CARD, tanpa ana penentu resistensi liyane sing diidentifikasi.
4. Rekonstruksi filogenetik lan pelacakan transmisi
Analisis polimorfisme nukleotida tunggal genom inti (cgSNP) nempatake isolat Zhejiang ing posisi tartamtu ing wit filogenetik global. Asil kasebut nuduhake yen galur Zhejiang mbentuk klompok monofiletik bebarengan karo galur saka Rusia, Mongolia, lan sawetara provinsi Cina sisih lor (Ningxia, Heilongjiang, Mongolia Dalam, Hebei, Gansu, Beijing). Klompok iki luwih lanjut dipérang dadi telung subklade sing béda (Klade 1-3), sing nuduhaké pirang-pirang acara introduksi independen.
Dudutan lan Implikasi
Panliten iki nyedhiyakake set data genomik presisi dhuwur pisanan saka B. abortus ing Provinsi Zhejiang lan ngasilake sawetara kesimpulan penting:
- Clear latar mburi genetik– Galur B. abortus sing nyebar ing Zhejiang kalebu ST2, sacara genomik dilestarikake kanthi apik, lan makili garis keturunan brucellosis sapi sing khas.
2. EviKekuwatan transmisi lintas regional– Analisis filogenetik ora ndhukung anané garis keturunan endemik independen ing Zhejiang. Nanging, data kasebut kanthi kuat nuduhake manawa galur kasebut asale saka Tiongkok sisih lor lan bisa uga duwe latar mburi evolusi sing padha karo galur saka Rusia lan Mongolia. Anane telung subklade nuduhake pirang-pirang kedadeyan introduksi sing kapisah.
3. Implikasi kesehatan masyarakat– Temuan iki nandheske pentinge pengawasan genomik kanggo brucellosis sanajan ing wilayah sing sacara tradisional ora endemik kayata Zhejiang. Sanajan jumlah kasus saiki sithik, piranti resolusi dhuwur kaya cgSNP bisa kanthi efektif nglacak sumber wabah impor lan nyedhiyakake bukti ilmiah kanggo ngganggu rantai transmisi sing ana gandhengane karo transportasi ternak antar provinsi.
Karya iki ora mung ngisi kesenjangan riset ing Provinsi Zhejiang nanging uga nyedhiyakake data dhasar anyar kanggo pengawasan patogen lan penilaian risiko brucellosis ing wilayah Delta Kali Yangtze.
Informasi Kertas:
Yang, Y., Shi, X., Chen, J., Wang, L., Wu, Z., Yao, W., … & Wu, B. (2026). Identifikasi lan analisis filogenetik saka pitung galur Brucella abortus ing Zhejiang, China. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, 16, 1758965.
Wektu kiriman: 10 Juni 2026