Panliten anyar sing diterbitake ingMikrobiomanganakake analisis metagenomik virus marang 846 mamalia cilik liar—kalebu kelelawar, tikus, lan tikus—sing diklumpukake ing Sierra Leone, Afrika Kulon. Panliten iki ngidentifikasi total 39 virus RNA sing ana gandhengane karo mamalia, sing kasusun saka 26 virus anyar lan 13 virus sing wis dikenal sadurunge. Antarane, kulawarga Paramyxoviridae nuduhake keragaman paling dhuwur, dene tikus nduweni jumlah spesies virus paling akeh (n = 26).
Penilaian risiko zoonotik nuduhake telung virus zoonotik sing dikenal—virus ensefalomiokarditis, virus Lassa, lan Rocahepevirus sp.—uga telung virus kanthi risiko tumpahan potensial: virus Melian, virus hepatitis tikus, lan Hunnivirus A. Khususé, ing antarane virus sing nembe diidentifikasi, Bat ledantevirus 2 nuduhake hubungan filogenetik sing paling cedhak karo virus Le Dantec sing nginfeksi manungsa. Analisis serologis luwih lanjut ndeteksi antibodi penetralisir nglawan virus iki ing 2,8% warga lokal, sing nuduhake paparan manungsa sadurunge, sing kemungkinan ora dideteksi.
Temuan iki nyoroti anané reservoir virus sing didominasi tikus ing Afrika Kulon lan nandheske pentinge strategi pengawasan terpadu ing antarmuka manungsa-kewan. Nggabungake skrining metagenomik karo validasi serologis nyedhiyakake kerangka kerja sing kuat kanggo ngenali virus kanthi potensi zoonotik lan limpahan.
Sajrone dasawarsa kepungkur, luwih saka 60% penyakit infeksi sing muncul ing manungsa asale saka reservoir kewan, kanthi kelelawar, tikus, lan tikus sing diakoni minangka inang utama virus zoonotik. Afrika dianggep minangka hotspot kanggo penyakit zoonotik. Contone, Sierra Leone nglaporake luwih saka 28.000 kasus sajrone wabah Ebola 2014-2016.
Senajan ana beban penyakit zoonotik sing signifikan ing wilayah iki, keragaman lan distribusi virus ing mamalia cilik liar isih durung cukup diidentifikasi. Kanggo ngatasi kesenjangan iki, para peneliti nindakake analisis virome sistematis saka 846 mamalia cilik liar sing dicekel ing telung situs ing Sierra Leone antarane taun 2018 lan 2023. Panliten iki ngarahake kanggo menehi ciri keragaman virus, ngenali calon kanthi potensi transmisi lintas spesies, netepake risiko zoonotik, lan ngasilake bukti kanggo ndhukung sistem peringatan dini kanggo penyakit infeksi sing muncul.
Metode Inti
Panliten iki ngetrapake alur kerja metagenomik virus sing komprehensif:
- Pangolahan sampel:Jaringan jantung, ati, limpa, paru-paru, lan ginjel dikumpulake, dikumpulake, dihomogenake, lan diekstraksi total RNA.
- Urutan lan perakitan:Penipisan RNA ribosom ditindakake sadurunge konstruksi perpustakaan, banjur sekuensing throughput dhuwur nggunakake platform Illumina NovaSeq 6000. Kontinjen virus dirakit de novo.
- Identifikasi virus:Virus diidentifikasi adhedhasar panyelarasan gen RNA polimerase (RdRp) sing gumantung karo RNA. Mung virus sing ana gandhengane karo vertebrata sing ditahan, ora kalebu virus bakteri, jamur, lan tanduran.
- Analisis Bioinformatika:Rekonstruksi filogenetik, analisis rekombinasi, pemodelan jaringan transmisi lintas spesies, lan penilaian risiko zoonotik ditindakake.
- Validasi serologis:Uji netralisasi pseudovirus adhedhasar VSV dikembangake kanggo Bat ledantevirus 2. Antibodi penetralisir dideteksi ing 2,8% sera manungsa, sing nyedhiyakake bukti potensial transmisi zoonotik.
SinauAsil
1. Panemuan lan Keragaman Virus
Panliten iki nganakake analisis sekuensing transkriptomik marang 846 kewan liar sing diklumpukake ing Sierra Leone, kalebu tikus, kelelawar, lan tikus curut. Adhedhasar urutan gen RNA polimerase (RdRp) sing gumantung karo RNA, total 39 virus RNA sing ana gandhengane karo mamalia diidentifikasi, sing kasusun saka 13 virus sing wis dikenal sadurunge lan 26 virus anyar.
Saka segi komposisi virus, kulawarga Paramyxoviridae nuduhake tingkat keragaman paling dhuwur ing kabeh telung ordo inang, diikuti dening Astroviridae lan Picornaviridae. Babagan distribusi inang, tikus nyumbang keragaman virus paling gedhe, kanthi total 26 spesies virus, sing nuduhake peran penting minangka reservoir keragaman virus ing wilayah kasebut.
2. Risiko Zoonosis
Penilaian risiko zoonotik ngidentifikasi telung virus zoonotik sing dikenal: virus ensefalomiokarditis, virus Lassa, lan spesies Rocahepevirus. Kajaba iku, telung virus—virus Melian, virus hepatitis tikus, lan Hunnivirus A—diidentifikasi nduweni risiko limpahan potensial.
Saka 26 virus sing nembe ditemokake, papat diprediksi nduweni potensi zoonotik sing dhuwur adhedhasar karakteristik filogenetik lan genomik. Khususé, Bat ledantevirus 2 nuduhake hubungan filogenetik sing paling cedhak karo virus Le Dantec sing nginfeksi manungsa.
Investigasi serologis sabanjure luwih ndhukung temuan iki, amarga antibodi penetralisir nglawan Bat ledantevirus 2 dideteksi ing 2,8% sera saka warga lokal. Asil iki nuduhake yen infeksi sing ora dikenali utawa asimtomatik bisa uga wis kedadeyan ing populasi manungsa, sing nyoroti jalur transmisi zoonotik potensial nanging sadurunge ora dideteksi.
3. Dinamika Transmisi Lintas Spesies
Analisis transmisi lintas spesies nuduhake yen tikus ngenggoni posisi sentral ing jaringan berbagi virus, tumindak minangka simpul kunci sing nggampangake ijol-ijolan virus antarane spesies inang. Total 15 virus diidentifikasi duwe potensi kanggo transmisi lintas spesies.
Analisis luwih lanjut babagan pola transmisi lintas-urutan nuduhake yen nuduhake virus luwih kerep kedadeyan ing antarane inang ing urutan taksonomi sing padha, sing nuduhake yen gegayutan inang nduweni peran penting ing dinamika transmisi. Kosok baline, kelelawar nuduhake kapasitas sing relatif luwih murah kanggo transmisi lintas-urutan.
Sing penting, bukti ekspansi jangkauan inang diamati ing virus tartamtu. Contone, virus Melian, sing sadurunge dianggep khusus kanggo tikus, uga dideteksi ing tikus ing panliten iki, sing nuduhake potensi owah-owahan ing adaptasi inang lan tambah risiko transmisi sing luwih akeh.
Dudutan lan Implikasi Kesehatan Masyarakat
- Keragaman virome sing dhuwur ing mamalia cilik liar:Panemon 39 virus RNA, kalebu 26 spesies anyar, nuduhake reservoir virus sing gedhe ing wilayah kasebut lan nglaporake kanggo pisanan virus anyar kanthi potensi zoonotik sing dhuwur (kayata, Bat ledantevirus 2).
- Tikus minangka target pengawasan prioritas:Tikus tumindak minangka pusat utama transmisi virus lan nggawa keragaman virus paling dhuwur, sing nuduhake risiko limpahan paling gedhe.
- Kebutuhan strategi pengawasan terpadu:Asil iki ndhukung prioritas tikus ing program pengawasan aktif lan ngetrapake pendekatan terpadu sing nggabungake metagenomik, serologi, lan pemantauan ekologis ing antarmuka manungsa-satwa liar.
Sakabèhé, panliten iki nyedhiyakake bukti penting kanggo ndhukung sistem peringatan dini lan kerangka kerja penilaian risiko kanggo penyakit zoonotik sing muncul, sing nguatake pentinge pengawasan proaktif ing wilayah berisiko tinggi.
Informasi Produk
Wektu kiriman: 23 Maret 2026